Цель Flappy Dunk — удерживать баскетбольный мяч в воздухе, щелкая мышью, избегая контакта с потолком или полом, а также обеспечивая прохождение мяча через многочисленные кольца. Цель состоит в том, чтобы набрать очки, успешно проведя мяч через кольцо, при этом пропущенный удар приведет к окончанию игры.